Bagi Pendaftar KIP, dibebaskan dari biaya pendaftaran. Sedangkan bagi Pendaftar NON KIP dikenakan Biaya Pendaftaran Seleksi Nasional PMB PTKKN Tahun 2024 adalah sebesar Rp. 150.000,-  (seratus lima puluh ribu rupiah). Sistem pembayaran dilakukan dengan cara mentransfer ke rekening Panitia Selnas PMB Tahun 2025 dinomor rekening BANK MANDIRI  :

107-00-2163-452-4  Atas Nama PMB INSTITUT KEAGAMAAN KRISTEN NEGERI 

Pembayaran bisa langsung ke Teller BAnk, ATM, Internet Banking, dan Mobile Banking. Dan mohon kepada para peserta jalur Non Kip agar menginformasikan atau mengirimkan setiap file bukti pembayaran ke admin PTKKN Masing-masing melalui Whatsapp sehingga memudahkan untuk verifikasi pembayaran. 

Adapun daftar nomor WA untuk konfirmasi pembayaran adalah sebagai berikut :

1. IAKN Ambon = Jhon Lakafin(0822 7148 4838)

2. IAKN Tarutung = Oka Simatupang (085373890125)

3. IAKN Manado = Aradus Cristo Tri (0895 1495 0976)

4. IAKN Toraja = Mario Markus, ST. (0853 9766 5764)

5. IAKN Palangka Raya = Joni Saputra, ST, M.Kom (0813 4758 3989)

6. IAKN Kupang = Yermi Imanuel Solukh, S.Ak (0812 3211 8059)

7. STAKPN Sentani = Penina B. Matruty (0811481706)

8. STAKN Mesias Sorong = Ardian Elia Rumenta (0823 1295 2157)