Bagi Pendaftar KIP, dibebaskan dari biaya pendaftaran. Sedangkan bagi Pendaftar NON KIP dikenakan Biaya Pendaftaran Seleksi Nasional PMB PTKKN Tahun 2024 adalah sebesar Rp. 150.000,-  (seratus lima puluh ribu rupiah). Sistem pembayaran dilakukan dengan cara mentransfer ke rekening masing-masing PTKKN sesuai dengan Perguruan Tinggi yang dituju. Adapun daftar nomor rekening masing-masing PTKKN, yaitu :

1. IAKN Ambon (Rek. BRI : 4864-01-000006-30-9 An. BPN 061 IAKN Ambon)

2. IAKN Tarutung (Rek. BTN : 1160.01.30.000008.4 An. BPN 125 IAKN Tarutung)

3. IAKN Manado (Rek. BRI : 7762-01-000014-30-7 An. BPN 049 STAKN Manado)

4. IAKN Toraja (Rek. BRI : 0232-01-000216-30-9 An. Bendahara Penerima STAKN Toraja)

5. IAKN Palangka Raya (Rek. BRI : 0243-01-001166-30-0 An. BPN 043 STAKN Palangka Raya)

6. IAKN Kupang (Rek. BRI : 0039-01-003477-30-4 An. BPN 039 STAKN Kupang)

7. STAKPN Sentani (Rek. Bank Mandiri : 154.00.0769052.6 An. STAKPN Sentani)

Apabila Pendaftar Non KIP telah melakukan transfer pembayaran ke rekening sesuai perguruan tinggi yang dituju, diharapkan masing-masing pendaftar Non KIP dapat mengirimkan bukti transfer tersebut via WA ke masing-masing operator perguruan tinggi yang dituju tersebut. Adapun daftar nomor WA untuk konfirmasi pembayaran adalah sebagai berikut :

1. IAKN Ambon = Yoakhina N. M. (0811470601)

2. IAKN Tarutung = Juni Santo S. (085362996917)

3. IAKN Manado = Cristo Mende (085394032224)

4. IAKN Toraja = Syane M. T. (085255446979)

5. IAKN Palangka Raya = Loure Florentina (081770877168) / Hendayani (082256370652)

6. IAKN Kupang = Melkisedek A. (085226363715)

7. STAKPN Sentani = Penina B. Matruty (0811481706)